home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00458 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  30 lines
  1. ************************************
  2. * Ribosomal protein S24e signature *
  3. ************************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic  and  archaebacterial ribosomal proteins can be grouped
  6. on the basis of sequence similarities. One of these families consists of:
  7.  
  8.  - Mammalian S24 [1].
  9.  - Xenopus S19 [2].
  10.  - Mucor racemosus S24 [3].
  11.  - Halobacterium marismortui HS15 [4].
  12.  
  13. These proteins  have  102  to  148  amino  acids.  As  a signature pattern, we
  14. selected a well conserved stretch  of 16 residues in the central part of these
  15. proteins.
  16.  
  17. -Consensus pattern: T-[RKH]-F-G-x(2)-K-T-x-G-[FY]-[GA]-x-[LIVM]-Y-D
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: December 1991 / First entry.
  21.  
  22. [ 1] Brown S.J., Jewell A., Maki C.G., Roufa D.J.
  23.      Gene 91:293-296(1990).
  24. [ 2] Amaldi F., Beccari E., Bozzoni I., Luo Z.-X., Pierandrei-Amaldi P.
  25.      Gene 17:311-316(1982).
  26. [ 3] Sosa L., Fonzi W.A., Sypherd P.S.
  27.      Nucleic Acids Res. 17:9319-9331(1989).
  28. [ 4] Kimura J., Arndt E., Kimura M.
  29.      FEBS Lett. 224:65-70(1987).
  30.